Giải pháp Nvidia Parabricks phân tích gen trên nền tảng GPU

Giải pháp Nvidia Parabricks

Giải pháp Nvidia Parabricks là gì

Giải pháp Nvidia Parabricks là bộ công cụ phân tích gen được tăng tốc bằng GPU, cung cấp các phiên bản được tối ưu hóa để sử dụng trong sinh học và y học.

Điều này giúp tăng tốc độ chạy, khả năng mở rộng quy trình làm việc và giảm chi phí tính toán.

Với việc sử dụng công nghệ tính toán tăng tốc toàn bộ hệ thống, Parabricks có khả năng xử lý dữ liệu trong vài phút.

Nó tương thích với tất cả các dòng máy đọc chuỗi hàng đầu và hỗ trợ nhiều quy trình sinh thái thông tin.

Đồng thời, Parabricks còn tích hợp trí tuệ nhân tạo để tăng độ chính xác và tùy chỉnh.

Đây là một giải pháp hiệu quả về chi phí và không gian, lý tưởng cho các dự án sinh thái thông tin quy mô lớn nhằm nâng cao hiểu biết về bệnh và quản lý bệnh tật.

Lợi ích của giải pháp

Tăng tốc ứng dụng với các công cụ hàng đầu

Một trong những lợi ích đáng kể của Nvidia Parabricks là khả năng sử dụng các công cụ hàng đầu được tăng tốc bằng GPU.

Các công cụ này bao gồm phân tích germline, somatic và RNA, mang lại hiệu suất và độ chính xác cao hơn so với các giải pháp chỉ dùng CPU truyền thống.

Hiệu suất nhanh hơn lên đến 100 lần

Một trong những điểm mạnh của giải pháp là khả năng tăng tốc xử lý dữ liệu lên đến 100 lần so với các giải pháp chỉ sử dụng CPU.

Điều này có nghĩa là thời gian xử lý được rút ngắn đáng kể, từ đó mang lại hiệu quả và tiết kiệm thời gian cho các nhà khoa học và nhà phân tích gen.

Lợi ích của Nvidia Parabricks

Cải thiện độ chính xác trong phân tích chuỗi

Giải pháp không chỉ tăng tốc xử lý dữ liệu, mà còn cải thiện độ chính xác của quá trình phân tích chuỗi.

Chúng ta có thể điều chỉnh DeepVariant theo phòng thí nghiệm của mình và áp dụng sức mạnh của học sâu vào phân tích gen để đạt được kết quả chính xác và tùy biến.

Xử lý nhiều dữ liệu trong thời gian ngắn hơn

Với sự kết hợp giữa khả năng tăng tốc xử lý và hiệu suất cao, giải pháp cho phép xử lý một lượng lớn dữ liệu trong thời gian ngắn hơn so với các giải pháp truyền thống chỉ sử dụng CPU.

Điều này giúp tăng tính khả thi và hiệu quả cho các dự án genôm quy mô lớn nhằm nâng cao hiểu biết và quản lý bệnh tật.

Công nghệ sử dụng trong giải pháp

Công nghệ sử dụng

GPU-Accelerated Computing

Một trong những yếu tố quan trọng đặc biệt của giải pháp là việc sử dụng tính toán tăng tốc GPU.

GPU-Accelerated Computing cho phép sử dụng các thành phần xử lý đồ họa (GPU) để thực hiện các phép tính phức tạp một cách hiệu quả hơn so với việc sử dụng CPU truyền thống.

Với sự hỗ trợ của GPU, giải pháp có thể xử lý dữ liệu di truyền nhanh chóng và hiệu quả hơn.

GPU cho phép xử lý song song của nhiều tác vụ cùng một lúc, giúp giảm thời gian chạy và tăng tốc độ tính toán.

Điều này đặc biệt hữu ích trong lĩnh vực gen, khi mà các tập tin dữ liệu rất lớn và yêu cầu một khối lượng tính toán cao.

Gold-Standard Germline, Somatic, and RNA Analysis

Giải pháp cung cấp các công cụ được tăng tốc để thực hiện các phân tích gen quan trọng, bao gồm germline, somatic và RNA analysis.

Các công cụ này được coi là tiêu chuẩn và được sử dụng rộng rãi trong lĩnh vực sinh học thông tin.

Germline analysis nhằm xác định các biến thể di truyền từ thế hệ này sang thế hệ khác.

Somatic analysis giúp phát hiện và phân tích các biến thể di truyền trong các tế bào không thể tái sinh.

Còn RNA analysis liên quan đến việc phân tích dữ liệu RNA để hiểu cấu trúc và chức năng của gen.

Nhờ việc sử dụng các công cụ được tối ưu hóa và tăng tốc, giải pháp cho phép các nhà nghiên cứu thực hiện các phân tích này một cách nhanh chóng và chính xác.

Deep Learning for Genomic Analysis

Deep Learning là một lĩnh vực trong trí tuệ nhân tạo mà các mạng nơ-ron sâu được sử dụng để học và hiểu các đặc trưng phức tạp từ dữ liệu.

Trong lĩnh vực phân tích gen, Deep Learning có thể được áp dụng để cải thiện độ chính xác và linh hoạt của các công cụ phân tích.

Nvidia Parabricks tích hợp Deep Learning vào quy trình phân tích gen để cải thiện độ chính xác.

Đặc biệt, nó cho phép điều chỉnh DeepVariant – một công cụ quan trọng trong việc gọi biến thể gen – để phù hợp với điều kiện thí nghiệm cụ thể của bạn.

Điều này giúp đảm bảo rằng kết quả phân tích của bạn là chính xác nhất có thể.

Scalability and Cost Efficiency

Giải pháp cung cấp khả năng mở rộng và hiệu quả về chi phí trong quy trình phân tích gen.

Với việc sử dụng GPU-Accelerated Computing, Parabricks cho phép xử lý dữ liệu gen lớn một cách nhanh chóng và hiệu quả.

Khả năng mở rộng của giải pháp cho phép bạn xử lý nhiều dự án genôm cùng một lúc, giúp tiết kiệm thời gian và công sức.

Đồng thời, việc sử dụng GPU cũng giúp giảm chi phí tính toán, vì GPU có khả năng xử lý song song nhanh hơn so với CPU.

Kiến trúc của giải pháp

Kiến trúc của giải pháp

Kiến trúc GPU-accelerated

Parabricks được thiết kế dựa trên kiến trúc GPU-accelerated, sử dụng sức mạnh của card đồ họa để tăng tốc xử lý dữ liệu.

GPU (Graphics Processing Unit) là một thành phần quan trọng trong việc xử lý đồ họa trên máy tính.

Tuy nhiên, GPU cũng có khả năng xử lý song song và tính toán số học rất nhanh.

Điều này làm cho nó trở thành một công cụ hữu ích trong các ứng dụng không chỉ liên quan đến đồ họa mà còn liên quan đến tính toán.

Kiến trúc full-stack accelerated computing

Giải pháp sử dụng kiến trúc full-stack accelerated computing để tăng tốc quá trình xử lý dữ liệu từ đầu đến cuối.

Kiến trúc này bao gồm việc sử dụng GPU-accelerated libraries để tăng cường tính toán trên GPU và tiết kiệm thời gian xử lý.

Sự kết hợp giữa GPU-accelerated libraries và Parabricks cho phép việc xử lý dữ liệu diễn ra một cách nhanh chóng và hiệu quả.

Tương thích với các dòng máy séquen hàng đầu

Giải pháp được thiết kế để tương thích với tất cả các dòng máy séquen hàng đầu.

Điều này đảm bảo rằng bạn có thể sử dụng Parabricks với bất kỳ loại máy séquen nào bạn đã sở hữu hoặc muốn sử dụng.

Sự linh hoạt này giúp giải pháp trở thành một công cụ phân tích gen linh hoạt và tiện ích cho các nhà nghiên cứu và các tổ chức y tế.

Hỗ trợ cho nhiều quy trình sinh thái thông tin

Không chỉ hỗ trợ một số quy trình sinh thái thông tin thông thường, Parabricks còn được thiết kế để hỗ trợ nhiều loại quy trình sinh thái thông tin khác nhau.

Điều này cho phép bạn linh hoạt trong việc áp dụng giải pháp cho các nhu cầu phân tích gen cụ thể của bạn.

Bất kể bạn đang làm việc với germline analysis, somatic analysis hay RNA analysis, giải pháp có khả năng xử lý và mang lại hiệu suất cao cho quy trình của bạn.

Ứng dụng trong y học

Ứng dụng trong Y học

Phân tích di truyền germline

Phân tích di truyền germline là một bước quan trọng trong nghiên cứu gen và di truyền.

Giải pháp cung cấp một công cụ tăng tốc GPU để thực hiện phân tích này với tốc độ nhanh hơn đáng kể so với các giải pháp CPU truyền thống.

Nhờ vào khả năng xử lý song song của GPU, giải pháp có thể xử lý hàng loạt dữ liệu di truyền trong thời gian ngắn.

Từ đó giúp giảm thiểu thời gian tính toán và tăng cường hiệu suất nghiên cứu.

Phân tích di truyền somatic

Phân tích di truyền somatic là một quy trình quan trọng trong việc tìm kiếm và phân loại các biến thể di truyền liên quan đến ung thư.

Với sự hỗ trợ của Parabricks, quá trình này có thể được thực hiện nhanh hơn rất nhiều so với các giải pháp CPU thông thường.

Việc tính toán tăng tốc GPU giúp xử lý dữ liệu di truyền somatic một cách hiệu quả và đáng tin cậy.

Từ đó giúp định vị chính xác các biến thể di truyền liên quan đến ung thư.

Phân tích RNA

Phân tích RNA là một quy trình quan trọng trong việc nghiên cứu bộ gen và sự biểu hiện gen của các tổ chức sống.

Parabricks cung cấp các công cụ tăng tốc GPU để xử lý phân tích RNA với tốc độ cao hơn và độ chính xác đáng tin cậy.

Sự kết hợp giữa công nghệ GPU và trí tuệ nhân tạo trong Parabricks cho phép điều chỉnh DeepVariant theo phù hợp với điều kiện phòng thí nghiệm của bạn.

Điều nay sẽ mang lại sức mạnh của học sâu vào phân tích di truyền gen của bạn.

Tăng tốc ứng dụng AI trong y học

Công nghệ AI đang ngày càng được sử dụng rộng rãi trong y học để xử lý và phân tích dữ liệu y khoa phức tạp.

Parabricks cung cấp khả năng tăng tốc GPU cho các ứng dụng AI trong y học, giúp xử lý dữ liệu y khoa lớn một cách hiệu quả và nhanh chóng.

Bằng việc tận dụng sức mạnh song song của GPU, giải pháp giúp bạn tiết kiệm thời gian tính toán và giảm thiểu chi phí.

Từ đó nâng cao hiệu suất và khả năng ứng dụng của công nghệ AI trong y học.

Ứng dụng trong sinh học

Ứng dụng trong sinh học

Phân tích chuỗi di truyền

Phân tích chuỗi di truyền là một phần quan trọng trong nghiên cứu sinh học hiện đại.

Giải pháp cung cấp các công cụ tăng tốc GPU để xử lý phân tích chuỗi di truyền với hiệu suất cao và độ chính xác đáng tin cậy.

Sử dụng Parabricks, bạn có thể xử lý một lượng lớn dữ liệu chuỗi di truyền trong thời gian ngắn.

Điều này giúp tiết kiệm thời gian và công sức cho các dự án sinh học quy mô lớn.

Phân tích dữ liệu gen

Phân tích dữ liệu gen là một bước quan trọng trong việc hiểu biết về sự biểu hiện gen và vai trò của các gen trong tổ chức sống.

Giải pháp cung cấp khả năng tăng tốc GPU cho việc phân tích dữ liệu gen, giúp xử lý một lượng lớn dữ liệu gen một cách nhanh chóng và hiệu quả.

Với sự kết hợp của công nghệ GPU và AI trong Parabricks, bạn có thể tinh chỉnh DeepVariant để phù hợp với điều kiện phòng thí nghiệm của bạn.

Điều này sẽ mang lại sự chính xác cao trong kết quả phân tích gen. 

Tìm kiếm biến thể gen

Tìm kiếm biến thể gen là một phần quan trọng trong việc khám phá và nghiên cứu các biến thể gene liên quan đến sự tiến triển bệnh tật.

Với sự hỗ trợ của Parabricks, quá trình này có thể được thực hiện một cách nhanh chóng và chính xác.

Công nghệ GPU cho phép xử lý hàng loạt dữ liệu gene một cách hiệu quả, từ đó giúp xác định chính xác các biến thể gen có liên quan đến bệnh tật..

Phân tích di truyền vi khuẩn

Phân tích di truyền vi khuẩn là một lĩnh vực quan trọng trong virology và microbiology.

Giải pháp cung cấp công cụ tăng tốc GPU để xử lý phân tích di truyền vi khuẩn với tốc độ cao và độ chính xác đáng tin cậy.

Bằng việc sử dụng Parabricks, bạn có thể xử lý một lượng lớn dữ liệu vi khuẩn một cách hiệu quả.

Điều này giúp nâng cao khả năng nghiên cứu và hiểu biết về các loại vi khuẩn.

Có thể bạn quan tâm

Trụ sở chính công ty Comlink

Liên hệ

Comlink_Adress_Logo

Địa chỉ

Tầng 3 Toà nhà VNCC 243A Đê La Thành Str Q. Đống Đa-TP. Hà Nội
Comlink_Workingtime_Logo

Giờ làm việc

Thứ Hai đến Thứ Sáu Từ 8:00 đến 17:30 Hỗ trợ trực tuyến: 24/7
Comlink_Email_Logo

E-mail

info@comlink.com.vn
Comlink_Phone_Logo

Phone

+84 98 58 58 247

Tư vấn

Please enable JavaScript in your browser to complete this form.